《安徽省食品安全條例（草案修改稿）》經審議并面向社會公眾公開征求意見后，經過修改形成了草案修改二稿，于7月25日上午提交安徽省十二屆人大第三十九次會議審議。相較于上一稿，修改二稿在強化政府職責、銷售轉基因食品的標示、餐廚廢棄物處理、學校周邊食品安全、違法處罰幅度等方面的規定上加以修改。值得關注的是，為了保護消費者的知情權和選擇權，草案修改二稿提出“銷售轉基因食品應當在轉基因食品銷售區域的醒目位置予以明示，提醒消費者注意。”
轉基因食品或將清晰標示
為了保護消費者的知情權和選擇權，草案修改二稿將此前關于銷售轉基因食品的標示要求，由“鼓勵”銷售轉基因食品的經營者設立轉基因食品銷售專區、專柜修改為“應當”設立。
同時，草案修改二稿提出“銷售轉基因食品應當在轉基因食品銷售區域的醒目位置予以明示，提醒消費者注意。”
餐廚廢棄物或將建立臺賬
修改二稿中還進一步對餐廚廢棄物的管理進行了明確規定：縣級以上人民政府及其有關部門應當采取措施，加強餐廚廢棄物的管理，防止餐廚廢棄物作為原料進入食品生產經營環節。餐廚廢棄物產生、收運、處置單位應當建立臺賬，詳細記錄餐廚廢棄物的種類、數量、去向、用途等情況。
將加強學校周邊食品安全監管
為了加大學校周邊食品攤販的管理和食品安全的監測，草案修改二稿中規定，縣級以上人民政府食品藥品監督管理、衛生計生等部門應當對幼兒園、中小學校周邊的食品安全加強管理和監督，依法查處違法經營行為，保障未成年人身體健康和生命安全。
對超限量使用食品添加劑等行為將提高罰款力度
為了保障人民群眾舌尖上的安全，草案修改二稿將進一步加大食品安全違法行為的處罰力度。對食品生產經營者食品添加劑使用記錄不符合要求、停產后恢復生產未報告、銷售散裝食品未采取保證食品安全措施等五項違法行為，拒不改正的，罰款幅度或將提高到一千元以上五千元以下。
對食品攤販在食品中添加可能危害人體健康的物質、超限量使用食品添加劑、使用餐廚廢棄物作為原料生產食品等行為，違法經營的食品貨值金額不足一千元的，罰款下限或將提高到一千元。小餐飲、食品攤販未在經營場所、攤位的顯著位置懸掛或者擺放信息公示卡、從業人員健康證明的行為，或將罰款下限提高到一百元。
